More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3914 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  100 
 
 
78 aa  154  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  84.62 
 
 
78 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  83.33 
 
 
78 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  82.05 
 
 
78 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  80.52 
 
 
79 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  77.33 
 
 
78 aa  119  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  75.64 
 
 
78 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  76 
 
 
77 aa  117  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  68.92 
 
 
82 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  65.38 
 
 
78 aa  106  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  68.42 
 
 
79 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  63.16 
 
 
79 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  61.04 
 
 
78 aa  100  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  64.47 
 
 
78 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  64 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  62.82 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  62.82 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  60.26 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  62.82 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  61.04 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  61.54 
 
 
79 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  62.82 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  61.84 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  62.82 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  62.82 
 
 
79 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  62.82 
 
 
79 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  61.84 
 
 
78 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  60.53 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  62.67 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  61.33 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  61.84 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  60.26 
 
 
81 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  60.26 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  60.81 
 
 
80 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  60.53 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  60.81 
 
 
80 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  61.04 
 
 
79 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  62.34 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  60 
 
 
106 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  61.04 
 
 
77 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  94.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  58.44 
 
 
77 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  60.53 
 
 
80 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  55.84 
 
 
77 aa  93.6  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  61.84 
 
 
78 aa  93.6  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  57.14 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  59.46 
 
 
80 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  59.46 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  57.14 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  59.21 
 
 
77 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  58.67 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  59.46 
 
 
78 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  60.81 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  58.67 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>