166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1515 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1515  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
81 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2415  phosphopantetheine-binding  53.75 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2417  phosphopantetheine-binding  45 
 
 
80 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  34.21 
 
 
80 aa  50.1  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  36.07 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  31.17 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  35.06 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3690  phosphopantetheine-binding protein  39.19 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  41.38 
 
 
76 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2518  phosphopantetheine-binding  31.17 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  33.78 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  35.62 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  32.47 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  36.36 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  33.78 
 
 
78 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0023  acyl carrier protein  32.43 
 
 
79 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143843  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  33.78 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  34.25 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  30.14 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  30.14 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  30.14 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  32.47 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  31.17 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  33.78 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  34.48 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  33.9 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  34.48 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  34.48 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  31.17 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  34.48 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  34.48 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  33.75 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  42.31 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  39.29 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  34.48 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  36.07 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  32.47 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  44.64 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1847  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  35.09 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  38.6 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  35.44 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  43.64 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  32.47 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  37.29 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  28.77 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  31.65 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  35.09 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  33.9 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  35.09 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  33.78 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  35.71 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  37.18 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0487  phosphopantetheine-binding  34.67 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  32.39 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  36.84 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  39.29 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  40.35 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  28.57 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  33.75 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  43.1 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  37.29 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40310  putative acyl carrier protein  35.19 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0674269  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  38.6 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  34.67 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  34.67 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  33.9 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  37.5 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5755  phosphopantetheine-binding  37.88 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  33.78 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  39.62 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  39.62 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  39.62 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>