148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1847 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1847  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1173  phosphopantetheine-binding  47.5 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0954  phosphopantetheine-binding  37.84 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.311548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  39.39 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  40 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  40 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  40 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  38.33 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  27.5 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  32.39 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  29.87 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9709  predicted protein  36.76 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  38.1 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  38.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  40.68 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1026  acyl carrier protein  40.35 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  40 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1515  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  35.85 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  35 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2415  phosphopantetheine-binding  36 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  35 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  35 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  38.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4169  phosphopantetheine-binding  30.56 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3479  hypothetical protein  51.06 
 
 		 1279 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.165023 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  32.2 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0522  acyl carrier protein  40.82 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000162549  hitchhiker  0.00260243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  35 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0517  acyl carrier protein  40.82 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000044528  decreased coverage  0.00212296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 78 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 79 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  38.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4184  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 74 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 89 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31440  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 127 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.820176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  36.07 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>