20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0954 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0954  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 78 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.311548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1847  phosphopantetheine-binding  37.84 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1173  phosphopantetheine-binding  41.1 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0034  phosphopantetheine-binding  32.73 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.5 
 
 		 6403 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  40.43 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  36.07 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  43.75 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  43.75 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1220  phosphopantetheine-binding  46 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  43.75 
 
 		 78 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>