151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1220 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1220  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 85 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2147  phosphopantetheine-binding  75.9 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1037  phosphopantetheine-binding  73.81 
 
 		 88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  71.08 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2776  Acyl carrier protein, AcpP  73.81 
 
 		 88 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1418  phosphopantetheine-binding  73.81 
 
 		 88 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.819274  normal  0.36565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1242  phosphopantetheine-binding  64.29 
 
 		 70 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  37.8 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2945  phosphopantetheine-binding  40.96 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0530278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3760  hypothetical protein  37.14 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  48.15 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  52.94 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  46 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  40.22 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  50.98 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  38.16 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  47.27 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  47.27 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  50 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  48.21 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  37.63 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  37.63 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  48.21 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  50 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  48.21 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  38.75 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  45.76 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  47.27 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  48.15 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  40 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  41.98 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  41.98 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  35.56 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  35.56 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  41.25 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  42.31 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  36.56 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  36.56 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  36.56 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  35.56 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1173  phosphopantetheine-binding  32.5 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  48.15 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9709  predicted protein  42.86 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14468  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  43.64 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  56 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  49.02 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0522  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000162549  hitchhiker  0.00260243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  36.96 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  48.15 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  45.1 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0517  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000044528  decreased coverage  0.00212296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  36.96 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1990  phosphopantetheine-binding  38.75 
 
 		 72 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.596379  normal  0.457201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 77 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 110 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  46 
 
 		 78 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  46.81 
 
 		 82 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  46.03 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71972  mitochondrial acyl carrier protein  48.78 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>