293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2117 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  100 
 
 
92 aa  183  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  98.91 
 
 
105 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  94.57 
 
 
92 aa  177  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  94.57 
 
 
95 aa  175  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  92.39 
 
 
94 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  92.31 
 
 
93 aa  168  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  92.31 
 
 
93 aa  168  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  91.21 
 
 
93 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  82.76 
 
 
94 aa  154  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  79.35 
 
 
93 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  78.26 
 
 
93 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  79.35 
 
 
93 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  79.12 
 
 
93 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  78.26 
 
 
93 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  78.26 
 
 
93 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  78.26 
 
 
93 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  78.26 
 
 
93 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  78.02 
 
 
98 aa  148  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  78.02 
 
 
98 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  78.02 
 
 
98 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  77.17 
 
 
95 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  77.17 
 
 
95 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  76.92 
 
 
102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  50.94 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  47.27 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  50.94 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  55.77 
 
 
75 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  49.06 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  44.44 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  44.64 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  46 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  46.15 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  47.17 
 
 
88 aa  52  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  48.15 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  47.06 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  47.06 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  45.28 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  42.86 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  50 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  41.07 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  48.98 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  41.07 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  42.86 
 
 
78 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  37.68 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  40.38 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1026  acyl carrier protein  41.94 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  39.62 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  42.59 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  42.59 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  42.59 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  41.07 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  43.1 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  41.07 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  34.55 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  49.02 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  41.07 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  38.18 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  38.89 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  41.38 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  45.28 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  38.89 
 
 
78 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  42.59 
 
 
77 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  44.64 
 
 
84 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  46 
 
 
79 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  38.89 
 
 
78 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  38.33 
 
 
88 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  43.1 
 
 
77 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  40.74 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31440  acyl carrier protein  38.46 
 
 
127 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.820176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  43.4 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  38.18 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  41.07 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  38.89 
 
 
81 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  44.26 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  41.07 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  42 
 
 
77 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  46.94 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  43.4 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  41.07 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  44 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  41.07 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  44.23 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  41.07 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  38.89 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  43.4 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  38.89 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  41.07 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  44.23 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  44 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  41.07 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  38.18 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  44.23 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  44.23 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>