More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3479 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3479  hypothetical protein  100 
 
 
1279 aa  2550    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.165023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  39.78 
 
 
1990 aa  347  7e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  38.98 
 
 
2033 aa  320  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.81 
 
 
3308 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 
2274 aa  296  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  33.98 
 
 
1550 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.93 
 
 
6889 aa  292  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3127  amino acid adenylation domain-containing protein  34 
 
 
629 aa  285  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  36.78 
 
 
1498 aa  284  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2492  amino acid adenylation domain protein  38.78 
 
 
590 aa  281  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124863  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  37.56 
 
 
1506 aa  279  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  31.9 
 
 
1317 aa  278  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  32.29 
 
 
1334 aa  276  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  29.95 
 
 
1336 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.78 
 
 
1870 aa  276  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  32.9 
 
 
1314 aa  275  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  35.84 
 
 
3539 aa  275  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  29.95 
 
 
2054 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  35.45 
 
 
3223 aa  273  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  28.97 
 
 
888 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  30.85 
 
 
1870 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.11 
 
 
3629 aa  269  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  33.56 
 
 
1454 aa  269  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  33.62 
 
 
2571 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  33.62 
 
 
2571 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  34.21 
 
 
9175 aa  267  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  38.86 
 
 
7785 aa  266  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  36.08 
 
 
5328 aa  264  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  36.65 
 
 
5750 aa  263  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  35.98 
 
 
4449 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  35.53 
 
 
2403 aa  263  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  35.06 
 
 
6202 aa  263  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  31.21 
 
 
6661 aa  263  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  32.79 
 
 
1127 aa  261  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.34 
 
 
4968 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  31.08 
 
 
4520 aa  261  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  37.52 
 
 
2412 aa  261  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  30.25 
 
 
2151 aa  260  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  35.19 
 
 
5929 aa  260  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  36.44 
 
 
1638 aa  260  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.36 
 
 
5738 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  35.46 
 
 
1332 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.7 
 
 
4960 aa  259  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  37.67 
 
 
8211 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  35.69 
 
 
1330 aa  259  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.81 
 
 
1336 aa  259  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.7 
 
 
6403 aa  258  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  30.62 
 
 
3786 aa  258  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  33.53 
 
 
1344 aa  257  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  33.2 
 
 
1296 aa  257  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  35.84 
 
 
11233 aa  256  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.69 
 
 
3208 aa  256  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.7 
 
 
4960 aa  255  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  37.33 
 
 
2614 aa  256  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4216  amino acid adenylation domain-containing protein  33.87 
 
 
568 aa  255  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  36.02 
 
 
1346 aa  255  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.72 
 
 
2156 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  33.44 
 
 
1668 aa  254  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  27.25 
 
 
1439 aa  253  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  33.92 
 
 
3086 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  33.92 
 
 
3086 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  35.71 
 
 
1368 aa  253  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  28.99 
 
 
2386 aa  253  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  32.64 
 
 
1786 aa  253  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  30.42 
 
 
2156 aa  253  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  29.28 
 
 
1393 aa  253  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  34.62 
 
 
2201 aa  253  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  32.17 
 
 
1753 aa  252  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  34.02 
 
 
2561 aa  252  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  35.52 
 
 
6999 aa  252  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  35.93 
 
 
5926 aa  252  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  34.92 
 
 
5372 aa  252  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  36.44 
 
 
2439 aa  252  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  31.54 
 
 
2164 aa  252  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2611  amino acid adenylation  32.95 
 
 
614 aa  251  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335751  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  35.52 
 
 
1360 aa  251  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  35.47 
 
 
1343 aa  251  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.27 
 
 
5953 aa  250  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  39.95 
 
 
4106 aa  250  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.61 
 
 
1779 aa  250  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2107  nonribosomal peptide synthetase, putative  33.4 
 
 
1456 aa  249  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.960336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  32.35 
 
 
2596 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  29.41 
 
 
2386 aa  249  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  35.05 
 
 
2845 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  36.65 
 
 
3410 aa  249  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  35.86 
 
 
6676 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.48 
 
 
2385 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  29.08 
 
 
1345 aa  248  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  35.23 
 
 
4383 aa  248  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  35.59 
 
 
5230 aa  248  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.44 
 
 
2385 aa  247  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.44 
 
 
2385 aa  247  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  36.4 
 
 
2350 aa  247  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  35.85 
 
 
1483 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  35.85 
 
 
1483 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  35.6 
 
 
1395 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  35.85 
 
 
1528 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  35.23 
 
 
5422 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  35.23 
 
 
4882 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.07 
 
 
2385 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>