More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4452 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  93.65 
 
 
1360 aa  2430    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  35.57 
 
 
1344 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  93.25 
 
 
1368 aa  2420    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5529  non-ribosomal peptide synthetase  77.67 
 
 
1356 aa  2000    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0099449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  59.3 
 
 
1345 aa  1494    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  75.52 
 
 
1351 aa  2000    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  43.01 
 
 
1346 aa  1006    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  44.06 
 
 
1332 aa  1034    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 
1395 aa  2771    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  58 
 
 
1358 aa  1490    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  75.3 
 
 
1343 aa  1960    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2107  nonribosomal peptide synthetase, putative  32.74 
 
 
1456 aa  612  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.960336  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14440  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  33.04 
 
 
1297 aa  513  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3770  non-ribosomal peptide synthetase  31.89 
 
 
1302 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1495  non-ribosomal peptide synthetase  33.13 
 
 
1316 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4411  non-ribosomal peptide synthetase  31.67 
 
 
1293 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.705527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15080  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.77 
 
 
1291 aa  491  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.628151  normal  0.903527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21070  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.5 
 
 
1309 aa  476  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.642428  normal  0.678739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5386  non-ribosomal peptide synthetase  30.95 
 
 
1318 aa  470  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1493  non-ribosomal peptide synthetase  31.4 
 
 
1337 aa  459  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5172  non-ribosomal peptide synthetase  32.44 
 
 
1311 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.066843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1404  non-ribosomal peptide synthetase  31.07 
 
 
1324 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4786  non-ribosomal peptide synthetase-like protein  31.95 
 
 
1311 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0680721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4872  non-ribosomal peptide synthetase  31.95 
 
 
1311 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.169627  normal  0.377916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6239  hypothetical protein  31.09 
 
 
1307 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380484  normal  0.45462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4602  non-ribosomal peptide synthetase  31.78 
 
 
1337 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381211  hitchhiker  0.000116463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  36.61 
 
 
3308 aa  331  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  36.86 
 
 
2156 aa  325  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  39.3 
 
 
1839 aa  325  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  36.62 
 
 
2156 aa  324  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.26 
 
 
6889 aa  324  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.35 
 
 
13537 aa  324  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.82 
 
 
9498 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  40.26 
 
 
3223 aa  323  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.4 
 
 
6676 aa  322  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  35.94 
 
 
2386 aa  322  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  34.78 
 
 
2581 aa  320  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  40.67 
 
 
3629 aa  317  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  35.58 
 
 
2156 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  40.41 
 
 
2403 aa  315  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.61 
 
 
5953 aa  314  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.74 
 
 
6403 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  38.66 
 
 
1769 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  39.04 
 
 
2614 aa  313  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  38.1 
 
 
5467 aa  312  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  39.32 
 
 
8211 aa  313  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  37.83 
 
 
1498 aa  313  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  36.67 
 
 
2571 aa  313  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  36.67 
 
 
2571 aa  313  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  39.3 
 
 
4090 aa  312  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  36.74 
 
 
2365 aa  312  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  33.61 
 
 
6202 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  38.77 
 
 
7310 aa  311  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  37.38 
 
 
4991 aa  310  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  35.55 
 
 
2033 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  34.49 
 
 
1556 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  38.36 
 
 
2187 aa  309  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  34.32 
 
 
1556 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  39.64 
 
 
2350 aa  308  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  35.54 
 
 
3086 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.45 
 
 
4317 aa  308  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  33.39 
 
 
6404 aa  307  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  33.23 
 
 
9175 aa  307  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  37.98 
 
 
1082 aa  307  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  34.1 
 
 
1439 aa  307  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.98 
 
 
1082 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  34.95 
 
 
3695 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.35 
 
 
2385 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.98 
 
 
1082 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  34.03 
 
 
2385 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.98 
 
 
1082 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  38.69 
 
 
1776 aa  306  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  36.07 
 
 
2006 aa  306  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  33.5 
 
 
1454 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.98 
 
 
1071 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.98 
 
 
1082 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  35.08 
 
 
3086 aa  305  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  37.28 
 
 
1990 aa  305  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 
1109 aa  304  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  37.06 
 
 
4531 aa  304  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  34.47 
 
 
1786 aa  304  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  36.43 
 
 
3470 aa  304  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.19 
 
 
2385 aa  303  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.19 
 
 
2385 aa  303  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  35.83 
 
 
2448 aa  303  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  38.98 
 
 
1449 aa  304  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  36.28 
 
 
1334 aa  303  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  37.85 
 
 
1082 aa  304  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  35.63 
 
 
2561 aa  303  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  38.21 
 
 
7785 aa  303  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  39.73 
 
 
2439 aa  303  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  33.97 
 
 
2385 aa  302  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3127  amino acid adenylation domain-containing protein  36.45 
 
 
629 aa  302  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  32.95 
 
 
2054 aa  302  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  36.5 
 
 
1506 aa  302  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  39.03 
 
 
5328 aa  301  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  33.28 
 
 
3235 aa  301  6e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2723  amino acid adenylation domain protein  38.62 
 
 
591 aa  301  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  35.5 
 
 
1336 aa  301  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.96 
 
 
4317 aa  300  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>