More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4411 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3770  non-ribosomal peptide synthetase  70.86 
 
 
1302 aa  1781    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14440  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  58.94 
 
 
1297 aa  1369    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1495  non-ribosomal peptide synthetase  61.8 
 
 
1316 aa  1468    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21070  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  59.18 
 
 
1309 aa  1394    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.642428  normal  0.678739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4602  non-ribosomal peptide synthetase  59.91 
 
 
1337 aa  1278    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381211  hitchhiker  0.000116463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6239  hypothetical protein  60.57 
 
 
1307 aa  1412    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380484  normal  0.45462 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15080  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  57.13 
 
 
1291 aa  1360    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.628151  normal  0.903527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4786  non-ribosomal peptide synthetase-like protein  68.09 
 
 
1311 aa  1634    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0680721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4411  non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 
1293 aa  2545    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.705527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1493  non-ribosomal peptide synthetase  60.93 
 
 
1337 aa  1449    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4872  non-ribosomal peptide synthetase  68.09 
 
 
1311 aa  1634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.169627  normal  0.377916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5386  non-ribosomal peptide synthetase  67.1 
 
 
1318 aa  1642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5172  non-ribosomal peptide synthetase  68.33 
 
 
1311 aa  1650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.066843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1404  non-ribosomal peptide synthetase  66.9 
 
 
1324 aa  1636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  35.24 
 
 
1332 aa  595  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  33.98 
 
 
1346 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.41 
 
 
1344 aa  502  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  33.43 
 
 
1343 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  32.79 
 
 
1351 aa  499  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2107  nonribosomal peptide synthetase, putative  30.64 
 
 
1456 aa  496  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.960336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5529  non-ribosomal peptide synthetase  32.71 
 
 
1356 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0099449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  31.23 
 
 
1358 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  31.88 
 
 
1360 aa  489  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  32.03 
 
 
1368 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  31.63 
 
 
1345 aa  479  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  31.76 
 
 
1395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.67 
 
 
6889 aa  272  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  36.93 
 
 
1638 aa  270  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.46 
 
 
5738 aa  262  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.56 
 
 
1550 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  33.84 
 
 
2820 aa  258  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  34.51 
 
 
1334 aa  258  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.65 
 
 
3629 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.3 
 
 
3308 aa  254  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  36.13 
 
 
1498 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  32.44 
 
 
2199 aa  253  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  32.44 
 
 
3235 aa  252  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  37.11 
 
 
1344 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  37.17 
 
 
1769 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  32.03 
 
 
1142 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  33.16 
 
 
1413 aa  248  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  34.57 
 
 
4520 aa  247  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.28 
 
 
2033 aa  247  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  32.91 
 
 
2883 aa  246  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  38.69 
 
 
2412 aa  245  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  35.46 
 
 
5953 aa  245  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  31.12 
 
 
2581 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  36.2 
 
 
7310 aa  244  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  34.15 
 
 
2138 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  30.49 
 
 
3086 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  34.36 
 
 
2710 aa  243  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  37.04 
 
 
2403 aa  242  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  33.5 
 
 
1525 aa  242  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  36.41 
 
 
2614 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  35.64 
 
 
5750 aa  242  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.19 
 
 
1556 aa  242  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.39 
 
 
3432 aa  241  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  30.49 
 
 
3086 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.01 
 
 
2385 aa  241  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  31.19 
 
 
1556 aa  241  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  36.35 
 
 
4090 aa  240  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  37.79 
 
 
2350 aa  240  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  31.39 
 
 
2176 aa  239  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.59 
 
 
6403 aa  239  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.84 
 
 
2385 aa  239  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  31.48 
 
 
627 aa  238  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  35.43 
 
 
2439 aa  238  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  35.62 
 
 
1990 aa  238  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.35 
 
 
13537 aa  238  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  32.01 
 
 
1093 aa  237  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.21 
 
 
2385 aa  237  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.67 
 
 
2571 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  36.05 
 
 
11233 aa  237  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  37.31 
 
 
7712 aa  237  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.67 
 
 
2571 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  31.16 
 
 
4354 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  32.65 
 
 
5596 aa  236  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.51 
 
 
2385 aa  235  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.79 
 
 
2386 aa  236  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  36.58 
 
 
2577 aa  236  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.01 
 
 
2385 aa  235  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.94 
 
 
2385 aa  235  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  34.48 
 
 
1689 aa  235  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  36.29 
 
 
1130 aa  234  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.94 
 
 
2385 aa  234  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  36.8 
 
 
3639 aa  234  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  30.12 
 
 
1454 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  34.21 
 
 
4747 aa  234  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  30.78 
 
 
1069 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  34.99 
 
 
4991 aa  233  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  38.35 
 
 
8211 aa  233  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  30.52 
 
 
1194 aa  232  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  36.13 
 
 
7785 aa  232  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.22 
 
 
1336 aa  232  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  36.14 
 
 
2626 aa  232  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0632  amino acid adenylation domain protein  36.71 
 
 
1479 aa  232  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  30.32 
 
 
2164 aa  232  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  35.84 
 
 
6113 aa  232  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  30.51 
 
 
2386 aa  231  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  32.52 
 
 
1127 aa  231  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>