More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1102 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5529  non-ribosomal peptide synthetase  58.15 
 
 
1356 aa  1491    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0099449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  57.63 
 
 
1351 aa  1502    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  73.07 
 
 
1358 aa  1946    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 
1345 aa  2716    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  42.93 
 
 
1346 aa  1043    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  45.18 
 
 
1332 aa  1090    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  59.04 
 
 
1360 aa  1475    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  59.22 
 
 
1343 aa  1508    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  59.04 
 
 
1368 aa  1464    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  57.81 
 
 
1395 aa  1447    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  33.31 
 
 
1344 aa  619  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3770  non-ribosomal peptide synthetase  31.41 
 
 
1302 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14440  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  30.75 
 
 
1297 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1493  non-ribosomal peptide synthetase  30.15 
 
 
1337 aa  476  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4411  non-ribosomal peptide synthetase  31.59 
 
 
1293 aa  469  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.705527  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5386  non-ribosomal peptide synthetase  30.48 
 
 
1318 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1495  non-ribosomal peptide synthetase  30.92 
 
 
1316 aa  466  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4786  non-ribosomal peptide synthetase-like protein  30.73 
 
 
1311 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0680721  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15080  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  30.43 
 
 
1291 aa  455  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.628151  normal  0.903527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4872  non-ribosomal peptide synthetase  30.73 
 
 
1311 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.169627  normal  0.377916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5172  non-ribosomal peptide synthetase  30.61 
 
 
1311 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.066843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1404  non-ribosomal peptide synthetase  29.52 
 
 
1324 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6239  hypothetical protein  30.3 
 
 
1307 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380484  normal  0.45462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4602  non-ribosomal peptide synthetase  31.06 
 
 
1337 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381211  hitchhiker  0.000116463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2107  nonribosomal peptide synthetase, putative  36.61 
 
 
1456 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.960336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  39.11 
 
 
7310 aa  350  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  33.28 
 
 
1454 aa  335  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.88 
 
 
2385 aa  332  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.72 
 
 
2033 aa  328  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.11 
 
 
2385 aa  327  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  34.17 
 
 
6202 aa  327  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  37.27 
 
 
1498 aa  327  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35.48 
 
 
3308 aa  325  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  35.32 
 
 
3235 aa  322  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.9 
 
 
3629 aa  321  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.33 
 
 
2385 aa  321  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  35.52 
 
 
2385 aa  319  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  34.92 
 
 
9175 aa  320  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  34.99 
 
 
2386 aa  318  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.37 
 
 
6403 aa  318  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.48 
 
 
5953 aa  318  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  35.68 
 
 
9498 aa  318  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  36.42 
 
 
3761 aa  317  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.42 
 
 
6889 aa  317  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  33.9 
 
 
1556 aa  317  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.94 
 
 
2385 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  37.97 
 
 
5372 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.61 
 
 
13537 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  33.89 
 
 
2156 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.78 
 
 
2385 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  37.97 
 
 
2614 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  35.61 
 
 
2386 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  37.91 
 
 
1449 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.88 
 
 
6676 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  33.73 
 
 
1556 aa  315  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  35.78 
 
 
2054 aa  313  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.35 
 
 
2385 aa  313  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.06 
 
 
2385 aa  312  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  35.77 
 
 
2561 aa  312  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.06 
 
 
2385 aa  312  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  33.86 
 
 
1439 aa  311  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  33.56 
 
 
2156 aa  310  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  33.95 
 
 
3086 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  37.59 
 
 
1344 aa  309  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  34 
 
 
1345 aa  309  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  36.06 
 
 
1776 aa  308  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  33.95 
 
 
3086 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  35.85 
 
 
2365 aa  308  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  36.33 
 
 
4090 aa  308  6e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  36.11 
 
 
2125 aa  308  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  33.06 
 
 
1550 aa  307  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  33 
 
 
1870 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21070  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.43 
 
 
1309 aa  306  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.642428  normal  0.678739 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  34.44 
 
 
3374 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.92 
 
 
4531 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  35.33 
 
 
5469 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  33.83 
 
 
2156 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  38.22 
 
 
4290 aa  305  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  34.44 
 
 
4968 aa  304  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  32.89 
 
 
2581 aa  304  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  33.77 
 
 
1142 aa  303  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.69 
 
 
6404 aa  303  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  38.77 
 
 
4318 aa  302  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  32.32 
 
 
1336 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  36.39 
 
 
4489 aa  303  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0624  amino acid adenylation domain protein  35.96 
 
 
1693 aa  302  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  35.7 
 
 
8211 aa  302  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.71 
 
 
1839 aa  301  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  35.22 
 
 
1714 aa  301  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1967  amino acid adenylation domain-containing protein  34.85 
 
 
1087 aa  301  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0381021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  36 
 
 
2350 aa  301  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  32.66 
 
 
1870 aa  301  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  31.31 
 
 
888 aa  300  9e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  35.59 
 
 
3470 aa  300  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  35.24 
 
 
5654 aa  300  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  33.39 
 
 
4960 aa  300  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.43 
 
 
3291 aa  300  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  34.25 
 
 
1769 aa  300  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.86 
 
 
4317 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.12 
 
 
4342 aa  299  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>