More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4662 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2107  nonribosomal peptide synthetase, putative  34.13 
 
 
1456 aa  724    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.960336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  42.86 
 
 
1360 aa  991    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  42.76 
 
 
1395 aa  970    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  100 
 
 
1346 aa  2727    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  65.21 
 
 
1332 aa  1764    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  42.63 
 
 
1343 aa  992    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  42.81 
 
 
1351 aa  1006    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5529  non-ribosomal peptide synthetase  42.28 
 
 
1356 aa  984    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0099449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  35.27 
 
 
1344 aa  701    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  43 
 
 
1345 aa  1033    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  43.04 
 
 
1368 aa  988    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  42.73 
 
 
1358 aa  1034    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3770  non-ribosomal peptide synthetase  33.88 
 
 
1302 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4411  non-ribosomal peptide synthetase  34.43 
 
 
1293 aa  567  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.705527  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14440  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  34.28 
 
 
1297 aa  548  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5172  non-ribosomal peptide synthetase  33.88 
 
 
1311 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.066843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5386  non-ribosomal peptide synthetase  32.27 
 
 
1318 aa  545  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15080  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  33.48 
 
 
1291 aa  544  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.628151  normal  0.903527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1495  non-ribosomal peptide synthetase  33.38 
 
 
1316 aa  543  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4786  non-ribosomal peptide synthetase-like protein  33.88 
 
 
1311 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0680721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4872  non-ribosomal peptide synthetase  33.88 
 
 
1311 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.169627  normal  0.377916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21070  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  33.98 
 
 
1309 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.642428  normal  0.678739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1493  non-ribosomal peptide synthetase  32.73 
 
 
1337 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1404  non-ribosomal peptide synthetase  32.87 
 
 
1324 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6239  hypothetical protein  32.71 
 
 
1307 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380484  normal  0.45462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4602  non-ribosomal peptide synthetase  32.77 
 
 
1337 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381211  hitchhiker  0.000116463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  36.17 
 
 
2033 aa  340  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  36.16 
 
 
2571 aa  333  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  36.16 
 
 
2571 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  38.28 
 
 
1990 aa  327  9e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.54 
 
 
3629 aa  327  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  33.66 
 
 
2054 aa  322  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  34.5 
 
 
2386 aa  322  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  37.44 
 
 
2419 aa  320  7.999999999999999e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.39 
 
 
2385 aa  318  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  33.23 
 
 
1550 aa  317  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  37.61 
 
 
2350 aa  317  9e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  35.21 
 
 
2883 aa  317  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  37.73 
 
 
3230 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.51 
 
 
6889 aa  315  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.11 
 
 
2385 aa  315  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  34.06 
 
 
3235 aa  315  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  36.75 
 
 
3710 aa  314  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.58 
 
 
4317 aa  314  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  35.74 
 
 
2614 aa  313  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  35.84 
 
 
4968 aa  311  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35.47 
 
 
3308 aa  311  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  37.62 
 
 
3348 aa  311  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  37 
 
 
1528 aa  311  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  37.28 
 
 
2448 aa  310  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  37 
 
 
1520 aa  311  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  35.84 
 
 
4106 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  37 
 
 
1483 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.97 
 
 
4317 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  37 
 
 
1483 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.51 
 
 
6403 aa  309  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  36.55 
 
 
3291 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  34.37 
 
 
2386 aa  308  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.87 
 
 
4317 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.38 
 
 
4317 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  33.77 
 
 
4960 aa  308  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  36.36 
 
 
4991 aa  308  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.37 
 
 
2385 aa  307  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  33 
 
 
2385 aa  308  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.37 
 
 
2385 aa  307  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  36.65 
 
 
4747 aa  307  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  33.76 
 
 
2006 aa  307  9.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  32.23 
 
 
2385 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  32.96 
 
 
1870 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  33.39 
 
 
4960 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  40.07 
 
 
5953 aa  306  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.21 
 
 
2385 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.13 
 
 
2385 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  32.68 
 
 
2156 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.9 
 
 
2385 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.83 
 
 
5738 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  32.96 
 
 
1870 aa  305  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  35.61 
 
 
6202 aa  305  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  37.72 
 
 
13537 aa  305  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  36.03 
 
 
6072 aa  305  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  32.68 
 
 
2156 aa  304  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  36.67 
 
 
6006 aa  304  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  36.64 
 
 
3328 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  39.04 
 
 
1498 aa  303  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  36.64 
 
 
3352 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  37.07 
 
 
3942 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  35.87 
 
 
6081 aa  303  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  34.1 
 
 
3498 aa  303  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.45 
 
 
3291 aa  303  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  31.12 
 
 
2543 aa  302  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 
1556 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  38.14 
 
 
2626 aa  301  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  35.34 
 
 
9175 aa  301  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  36.38 
 
 
1405 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  36.79 
 
 
3470 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  37.04 
 
 
3180 aa  300  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  33.18 
 
 
1556 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.11 
 
 
7541 aa  300  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  38.07 
 
 
1506 aa  300  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  35.36 
 
 
2867 aa  299  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>