More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3770 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4411  non-ribosomal peptide synthetase  70.93 
 
 
1293 aa  1755    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.705527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3770  non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 
1302 aa  2585    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6239  hypothetical protein  58.86 
 
 
1307 aa  1388    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380484  normal  0.45462 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15080  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  57.17 
 
 
1291 aa  1353    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.628151  normal  0.903527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1495  non-ribosomal peptide synthetase  61.14 
 
 
1316 aa  1460    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21070  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  59.71 
 
 
1309 aa  1412    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.642428  normal  0.678739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4786  non-ribosomal peptide synthetase-like protein  67.59 
 
 
1311 aa  1673    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0680721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4602  non-ribosomal peptide synthetase  58.52 
 
 
1337 aa  1254    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381211  hitchhiker  0.000116463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1493  non-ribosomal peptide synthetase  61.37 
 
 
1337 aa  1471    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4872  non-ribosomal peptide synthetase  67.59 
 
 
1311 aa  1673    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.169627  normal  0.377916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5386  non-ribosomal peptide synthetase  67.12 
 
 
1318 aa  1676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5172  non-ribosomal peptide synthetase  68.13 
 
 
1311 aa  1687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.066843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1404  non-ribosomal peptide synthetase  66.59 
 
 
1324 aa  1659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14440  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  57.71 
 
 
1297 aa  1348    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  33.58 
 
 
1346 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  33.68 
 
 
1332 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  31.95 
 
 
1358 aa  512  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  31.38 
 
 
1345 aa  505  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  32.26 
 
 
1360 aa  499  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  31.91 
 
 
1344 aa  494  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  32.52 
 
 
1368 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  32.04 
 
 
1351 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  32.64 
 
 
1343 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2107  nonribosomal peptide synthetase, putative  29.54 
 
 
1456 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.960336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5529  non-ribosomal peptide synthetase  31.72 
 
 
1356 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0099449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  32.25 
 
 
1395 aa  483  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  34.89 
 
 
1638 aa  266  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.24 
 
 
6889 aa  244  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  31.55 
 
 
1550 aa  241  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  35.98 
 
 
2201 aa  238  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.34 
 
 
3308 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  34.52 
 
 
3168 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  36.21 
 
 
1769 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  35.81 
 
 
2614 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  32.2 
 
 
2820 aa  235  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  30.48 
 
 
5738 aa  235  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  34.52 
 
 
2573 aa  235  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  32.53 
 
 
2199 aa  236  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  30.85 
 
 
3235 aa  234  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  29.94 
 
 
1454 aa  234  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.77 
 
 
3133 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.77 
 
 
3127 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.83 
 
 
3629 aa  234  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  36.04 
 
 
7310 aa  234  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  29.92 
 
 
1142 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.77 
 
 
4239 aa  234  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  33.28 
 
 
2571 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  33.28 
 
 
2571 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  34.52 
 
 
4520 aa  233  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.9 
 
 
2156 aa  233  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  34.77 
 
 
4265 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  34.77 
 
 
4265 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  31.29 
 
 
1127 aa  233  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.87 
 
 
2385 aa  231  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  31.58 
 
 
2273 aa  231  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.71 
 
 
2385 aa  231  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  32.05 
 
 
2581 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.64 
 
 
2385 aa  230  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  30.69 
 
 
2156 aa  230  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.48 
 
 
2385 aa  229  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  29.93 
 
 
2386 aa  229  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  32.42 
 
 
2710 aa  228  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.71 
 
 
2385 aa  228  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.71 
 
 
2385 aa  228  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  29.9 
 
 
1439 aa  228  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  32.05 
 
 
9175 aa  228  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  34.43 
 
 
1344 aa  228  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.15 
 
 
2385 aa  227  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  34.34 
 
 
1310 aa  227  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.79 
 
 
5953 aa  226  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  36.74 
 
 
2512 aa  226  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.48 
 
 
2385 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  31.16 
 
 
2033 aa  226  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.4 
 
 
5929 aa  226  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  29.01 
 
 
2176 aa  226  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  30.83 
 
 
2386 aa  226  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.38 
 
 
1714 aa  225  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.32 
 
 
2385 aa  225  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  36.36 
 
 
4090 aa  225  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.78 
 
 
6403 aa  224  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.2 
 
 
1806 aa  224  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.67 
 
 
5926 aa  224  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  32.44 
 
 
1470 aa  224  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4121  amino acid adenylation domain protein  36.45 
 
 
1583 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.183322  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  32.44 
 
 
1470 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  29.63 
 
 
1556 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  29.15 
 
 
3086 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  34.36 
 
 
5750 aa  223  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0632  amino acid adenylation domain protein  35.04 
 
 
1479 aa  222  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  32.88 
 
 
1334 aa  223  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  32.59 
 
 
1990 aa  222  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  35.3 
 
 
2365 aa  222  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  33.83 
 
 
2596 aa  222  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  33.45 
 
 
1498 aa  222  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  30.74 
 
 
1689 aa  222  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  30.19 
 
 
1556 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  35.63 
 
 
2403 aa  221  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  29.15 
 
 
3086 aa  222  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  33.71 
 
 
4489 aa  221  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.25 
 
 
7122 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>