More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0632 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0624  amino acid adenylation domain protein  35.87 
 
 
1693 aa  718    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0632  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1479 aa  2888    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2696  amino acid adenylation domain-containing protein  33.62 
 
 
1762 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502345  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12405  peptide synthetase mbtE  33.19 
 
 
1731 aa  612  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.517103  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  34.25 
 
 
1745 aa  609  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  34.25 
 
 
1745 aa  609  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  34.25 
 
 
1745 aa  609  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  32.39 
 
 
1721 aa  591  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4320  amino acid adenylation domain protein  35.23 
 
 
1653 aa  497  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  27.91 
 
 
3308 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  31.94 
 
 
2125 aa  452  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  32.11 
 
 
4489 aa  453  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  32.02 
 
 
4090 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  27.23 
 
 
2386 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.53 
 
 
2385 aa  439  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.77 
 
 
2385 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.16 
 
 
2385 aa  436  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.89 
 
 
7310 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  31.81 
 
 
2614 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.99 
 
 
2385 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  27.3 
 
 
2385 aa  433  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.27 
 
 
2385 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.99 
 
 
2385 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  32.7 
 
 
8211 aa  432  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  26.57 
 
 
2385 aa  429  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  30.88 
 
 
5328 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  34.21 
 
 
6113 aa  429  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  25.31 
 
 
2581 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.05 
 
 
2385 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  26.99 
 
 
7168 aa  423  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  27.88 
 
 
1569 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  31.64 
 
 
4106 aa  417  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  31.01 
 
 
2151 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  27.32 
 
 
4502 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  32.87 
 
 
1776 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  30.32 
 
 
2386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  24.5 
 
 
3291 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  31.56 
 
 
4747 aa  409  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  29.37 
 
 
2561 aa  409  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  29.59 
 
 
2189 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.67 
 
 
1336 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.29 
 
 
2154 aa  407  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  25.4 
 
 
1550 aa  406  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  31.09 
 
 
3223 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  26.81 
 
 
3498 aa  406  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  32.69 
 
 
1110 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  29.74 
 
 
6403 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.86 
 
 
6676 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  30.8 
 
 
7785 aa  403  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  29.35 
 
 
4136 aa  400  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.35 
 
 
3176 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  28.18 
 
 
4478 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  31.91 
 
 
1789 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  28.47 
 
 
5596 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  26.26 
 
 
3235 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  30.54 
 
 
1753 aa  397  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  28.93 
 
 
2791 aa  396  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  28.42 
 
 
1786 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.3 
 
 
4968 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.63 
 
 
5149 aa  396  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  28.64 
 
 
2448 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  30.83 
 
 
6999 aa  396  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  29.5 
 
 
3761 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  31.08 
 
 
3404 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  30.7 
 
 
5230 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.28 
 
 
6889 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  27.25 
 
 
4336 aa  390  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  31.78 
 
 
4449 aa  390  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  31.98 
 
 
2350 aa  389  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  30.06 
 
 
11233 aa  390  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  31.47 
 
 
6176 aa  389  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  31.55 
 
 
3348 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.06 
 
 
5750 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  32.02 
 
 
1130 aa  389  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  28.94 
 
 
3432 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  31.38 
 
 
5953 aa  387  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.96 
 
 
4531 aa  387  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  28.93 
 
 
6081 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.64 
 
 
9498 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.49 
 
 
7541 aa  386  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  29.29 
 
 
5213 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  26.09 
 
 
2164 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  34.12 
 
 
2403 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  25.17 
 
 
2156 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  29.3 
 
 
2845 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  31.45 
 
 
3291 aa  383  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  27.82 
 
 
2054 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.02 
 
 
1839 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  31.13 
 
 
2605 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  27.6 
 
 
1578 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  28.41 
 
 
1069 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  27.84 
 
 
3432 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  26.1 
 
 
2752 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  25.12 
 
 
1556 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  26.87 
 
 
4960 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  27.97 
 
 
2156 aa  379  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  30.2 
 
 
1127 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  29.46 
 
 
5620 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  29.54 
 
 
4342 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  33.06 
 
 
1779 aa  380  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>