More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1002 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  57.92 
 
 		 1395 aa  1448    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 		 1358 aa  2719    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  58.95 
 
 		 1343 aa  1492    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5529  non-ribosomal peptide synthetase  58.14 
 
 		 1356 aa  1486    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0099449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  42.73 
 
 		 1346 aa  1032    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  44.26 
 
 		 1332 aa  1054    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  58.97 
 
 		 1368 aa  1460    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  73.07 
 
 		 1345 aa  1948    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  59.03 
 
 		 1360 aa  1470    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  58.23 
 
 		 1351 aa  1515    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2107  nonribosomal peptide synthetase, putative  32.97 
 
 		 1456 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.960336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3770  non-ribosomal peptide synthetase  31.67 
 
 		 1302 aa  506  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21070  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.03 
 
 		 1309 aa  485  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.642428  normal  0.678739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14440  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  31.74 
 
 		 1297 aa  485  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1495  non-ribosomal peptide synthetase  31.48 
 
 		 1316 aa  479  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5386  non-ribosomal peptide synthetase  30.53 
 
 		 1318 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15080  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  31.99 
 
 		 1291 aa  476  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.628151  normal  0.903527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4411  non-ribosomal peptide synthetase  31.56 
 
 		 1293 aa  476  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.705527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1493  non-ribosomal peptide synthetase  30.93 
 
 		 1337 aa  466  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5172  non-ribosomal peptide synthetase  30.79 
 
 		 1311 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.066843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4786  non-ribosomal peptide synthetase-like protein  30.78 
 
 		 1311 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0680721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4872  non-ribosomal peptide synthetase  30.78 
 
 		 1311 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.169627  normal  0.377916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6239  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1307 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380484  normal  0.45462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1404  non-ribosomal peptide synthetase  30.35 
 
 		 1324 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  33.57 
 
 		 1344 aa  416  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4602  non-ribosomal peptide synthetase  32.55 
 
 		 1337 aa  416  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381211  hitchhiker  0.000116463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  39.94 
 
 		 7310 aa  350  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  35.78 
 
 		 2033 aa  348  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  36.98 
 
 		 3308 aa  329  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  34.88 
 
 		 1454 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.69 
 
 		 6889 aa  328  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  38.46 
 
 		 1498 aa  328  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  34.33 
 
 		 1556 aa  328  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  34 
 
 		 1556 aa  327  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.2 
 
 		 1839 aa  325  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  35.11 
 
 		 2581 aa  325  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  33.75 
 
 		 3086 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  36.82 
 
 		 5213 aa  323  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  33.75 
 
 		 3086 aa  322  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  37.66 
 
 		 1714 aa  321  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.93 
 
 		 5953 aa  319  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  34.85 
 
 		 2054 aa  319  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  35.98 
 
 		 1990 aa  318  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.66 
 
 		 2385 aa  317  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  32.94 
 
 		 6202 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  35.71 
 
 		 1142 aa  317  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  35.51 
 
 		 4747 aa  315  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.34 
 
 		 2385 aa  315  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  33.97 
 
 		 6404 aa  314  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.97 
 
 		 3291 aa  313  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  39.44 
 
 		 2614 aa  313  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  32.94 
 
 		 1870 aa  313  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  33.81 
 
 		 9175 aa  312  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.65 
 
 		 2385 aa  311  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  32.94 
 
 		 1870 aa  311  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  32.57 
 
 		 2156 aa  310  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  34.98 
 
 		 2273 aa  310  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  34.89 
 
 		 2156 aa  310  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  35.31 
 
 		 2385 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.38 
 
 		 2385 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  34.43 
 
 		 2386 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.47 
 
 		 6403 aa  310  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  36 
 
 		 4960 aa  308  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  38.21 
 
 		 3629 aa  309  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.86 
 
 		 2385 aa  308  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  33.56 
 
 		 2156 aa  309  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  36.52 
 
 		 1769 aa  308  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  37.58 
 
 		 4489 aa  308  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  35.67 
 
 		 4960 aa  308  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  34.14 
 
 		 2385 aa  307  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  37.09 
 
 		 2125 aa  307  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  33.39 
 
 		 3235 aa  307  9.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.08 
 
 		 2385 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.08 
 
 		 2385 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  35.57 
 
 		 2606 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  35.97 
 
 		 9498 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  38.57 
 
 		 4318 aa  306  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  36.67 
 
 		 2596 aa  306  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  34.33 
 
 		 5596 aa  306  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  33.94 
 
 		 2386 aa  305  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 2571 aa  305  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 2571 aa  305  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.49 
 
 		 4336 aa  305  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  38.66 
 
 		 2439 aa  304  7.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36 
 
 		 2883 aa  304  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.69 
 
 		 4342 aa  304  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  35.42 
 
 		 3470 aa  304  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  36.39 
 
 		 2875 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  33.8 
 
 		 888 aa  303  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  34.78 
 
 		 2164 aa  303  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  33.96 
 
 		 1550 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  35.69 
 
 		 13537 aa  303  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  38.22 
 
 		 5750 aa  303  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  35.12 
 
 		 2561 aa  301  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  34.08 
 
 		 4968 aa  301  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  36.36 
 
 		 2151 aa  301  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  34.76 
 
 		 3432 aa  301  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  35.12 
 
 		 1518 aa  301  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.74 
 
 		 4336 aa  301  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1967  amino acid adenylation domain-containing protein  36.42 
 
 		 1087 aa  301  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>