More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2492 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2492  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
590 aa  1143    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  39.37 
 
 
1990 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  39.2 
 
 
2033 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  36.36 
 
 
1550 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  36.96 
 
 
3308 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  43.27 
 
 
2350 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3127  amino acid adenylation domain-containing protein  35.39 
 
 
629 aa  329  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  35.4 
 
 
1127 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  35.77 
 
 
2867 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  35.01 
 
 
627 aa  326  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.38 
 
 
6889 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2568  amino acid adenylation domain-containing protein  33.28 
 
 
1083 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.403624  hitchhiker  0.0000320919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  36.98 
 
 
2571 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  36.98 
 
 
2571 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  34.43 
 
 
6202 aa  319  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  36.05 
 
 
1093 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  35.03 
 
 
1345 aa  317  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  33.8 
 
 
625 aa  317  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2723  amino acid adenylation domain protein  40.7 
 
 
591 aa  313  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  32.94 
 
 
1454 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  32.75 
 
 
1336 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  33.74 
 
 
9175 aa  310  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  38.28 
 
 
1498 aa  308  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.22 
 
 
13537 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  38.24 
 
 
9498 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  40.22 
 
 
7785 aa  306  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  33.9 
 
 
1069 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  40.18 
 
 
2187 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  32.75 
 
 
888 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  32.58 
 
 
1922 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  36.26 
 
 
1714 aa  302  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  39.25 
 
 
5422 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  39.38 
 
 
3223 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  36.93 
 
 
5929 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  32.7 
 
 
2054 aa  301  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  38.73 
 
 
5926 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  32.15 
 
 
1533 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  34.49 
 
 
2581 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  36.09 
 
 
3761 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  30.76 
 
 
1439 aa  299  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  32.4 
 
 
2151 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  39.63 
 
 
4449 aa  297  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  34.08 
 
 
1331 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  38.71 
 
 
1506 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  33.68 
 
 
5738 aa  296  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  34.24 
 
 
1786 aa  296  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  40.37 
 
 
4882 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  39.39 
 
 
2614 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1976  amino acid adenylation  34.79 
 
 
1373 aa  294  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  32.26 
 
 
1533 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  38.71 
 
 
2412 aa  292  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  38.58 
 
 
6403 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32.72 
 
 
7168 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  33.97 
 
 
4960 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  31.57 
 
 
1556 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  34.7 
 
 
1518 aa  291  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  33.9 
 
 
2164 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  33.62 
 
 
4960 aa  291  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  36.76 
 
 
4520 aa  290  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  35.85 
 
 
4383 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  37.39 
 
 
2136 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  38.87 
 
 
3786 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.57 
 
 
1556 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  34.87 
 
 
1518 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.24 
 
 
6404 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  35.08 
 
 
2176 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  38.86 
 
 
6676 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  33.45 
 
 
1142 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  35.26 
 
 
1578 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  38.67 
 
 
4991 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  32.84 
 
 
3770 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.830211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  33.06 
 
 
2006 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  38.02 
 
 
4747 aa  288  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.45 
 
 
3432 aa  287  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  35.74 
 
 
5469 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.9 
 
 
1870 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.9 
 
 
1870 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  37.76 
 
 
3168 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  38.59 
 
 
2403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  39.69 
 
 
8211 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6834  non-ribosomal peptide synthetase  39.44 
 
 
1053 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445692  normal  0.613796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  34.86 
 
 
1553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.91 
 
 
5953 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  34.47 
 
 
1518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  33.45 
 
 
2199 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  36.07 
 
 
1314 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  37.12 
 
 
2201 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3874  amino acid adenylation domain protein  37.98 
 
 
1665 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0218124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  36.81 
 
 
3650 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  36.44 
 
 
11233 aa  283  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  32.99 
 
 
2156 aa  283  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  39.1 
 
 
8914 aa  283  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  37.25 
 
 
5698 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  36.23 
 
 
2154 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  39.22 
 
 
2577 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.82 
 
 
8646 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  30.23 
 
 
3235 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  34.64 
 
 
4968 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  32.65 
 
 
2156 aa  281  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  39.49 
 
 
1436 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>