More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3427 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  100 
 
 
97 aa  189  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  100 
 
 
97 aa  189  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  100 
 
 
97 aa  189  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  93.75 
 
 
99 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  92.71 
 
 
99 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  76.84 
 
 
101 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  93.68 
 
 
115 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  91.25 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  72 
 
 
80 aa  113  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  72 
 
 
81 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  67.9 
 
 
87 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  71.62 
 
 
79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  68.42 
 
 
80 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  65.82 
 
 
79 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  61.84 
 
 
82 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  63.29 
 
 
79 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  60.53 
 
 
82 aa  103  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  60.76 
 
 
82 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  64 
 
 
79 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  62.34 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  62.67 
 
 
81 aa  97.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  60 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  60 
 
 
79 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  58.44 
 
 
81 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  58.23 
 
 
82 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  58.44 
 
 
81 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  57.33 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  56.96 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  55.13 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  56 
 
 
81 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  55.84 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  55.13 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  54.55 
 
 
82 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  55.84 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  55.84 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  50.67 
 
 
85 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  44.16 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  44.16 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  47.3 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  52.31 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  41.33 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  45.83 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  47.06 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  40.79 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  43.24 
 
 
81 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  50 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  41.33 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0466  acyl carrier protein  37.14 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0816145  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  46.27 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  47.62 
 
 
78 aa  62  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  41.46 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  47.76 
 
 
77 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  42.47 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  46.58 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2212  acyl carrier protein  31.4 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.266286  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  42.67 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  41.1 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  50 
 
 
76 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  41.46 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  41.79 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  42.25 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  36.36 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  43.66 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  43.06 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  48.48 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  42.47 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  36.36 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  37.66 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  40 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  44.29 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  42.25 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  36.36 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  36.25 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  47.69 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  37.66 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  39.47 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  40 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  39.47 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  40.85 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  40.85 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  43.24 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  43.24 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  43.24 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  43.24 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  43.24 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  43.24 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  43.24 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  43.24 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  44.29 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  39.47 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  40.3 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  45.31 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>