90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4169 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4169  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
79 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  40.51 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1173  phosphopantetheine-binding  32.88 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  40.54 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  40.54 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  38.81 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  31.58 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  40.28 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  39.19 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  39.19 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  39.19 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  39.19 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  39.19 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04530  phosphopantetheine-containing protein  32.89 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.832197  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01040  acyl carrier protein  32.88 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.218894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  38.81 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2390  putative actinorhodin polyketide synthase acyl carrier protein (ACP) (ActI ORF3)  31.94 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.281491  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  33.33 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23640  phosphopantetheine-containing protein  35.53 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.309349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  34.33 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  34.33 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  34.33 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0682  phosphopantetheine-binding  37.14 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00523  polyketide synthase, putative (JCVI)  38.18 
 
 
2476 aa  43.9  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657884  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  34.72 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  36.11 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  36.11 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  36.11 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  34.33 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  34.33 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2415  phosphopantetheine-binding  42.03 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  35.82 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  41.54 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08383  polyketide synthase, putative (JCVI)  35.48 
 
 
2476 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  43.55 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  38.1 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4850  acyl carrier protein  32.47 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.633798  normal  0.0406767 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1847  phosphopantetheine-binding  30.56 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  38.1 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4000  hypothetical protein  30.14 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  37.88 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  37.88 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  35.29 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  33.33 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  33.33 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  36.62 
 
 
78 aa  42  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  33.33 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  37.88 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  33.33 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  36.51 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0034  phosphopantetheine-binding  36.21 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  37.88 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  37.31 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  35.82 
 
 
77 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  37.88 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  34.33 
 
 
78 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  34.33 
 
 
78 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  35.82 
 
 
78 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  34.33 
 
 
99 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  32.35 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  34.38 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  36.36 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  35.82 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1903  acyl carrier protein  31.08 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0925633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  35.82 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1990  phosphopantetheine-binding  31.51 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.596379  normal  0.457201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  32.86 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03230  polyketide synthase, putative (JCVI)  43.64 
 
 
2193 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  43.75 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  39.68 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  43.75 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  31.88 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  32.84 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0779  phosphopantetheine-binding protein  26.87 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  42.55 
 
 
80 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  43.75 
 
 
79 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>