38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4000 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4000  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  29.63 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  38.1 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  38.1 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  32.5 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4169  phosphopantetheine-binding  30.14 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  36.54 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  36.54 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  36.54 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  36.54 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  30.43 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0658  phosphopantetheine-binding  30.14 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00184393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 79 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 75 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 79 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  31.75 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  31.75 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  31.75 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  31.75 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  30.91 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  31.75 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  38.18 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  38 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 79 aa  40  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  33.85 
 
 		 82 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>