More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3483 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  154  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  96.34 
 
 		 82 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  77.92 
 
 		 82 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  69.51 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  71.05 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  74.03 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  74.32 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  60.53 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  69.33 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  57.32 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  63.16 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  67.53 
 
 		 79 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  70.42 
 
 		 81 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  57.14 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  56.58 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 81 aa  94  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 81 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  49.35 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 82 aa  88.6  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  59.02 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  58.44 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  53.25 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  51.28 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  47.56 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  52.56 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  53.03 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  47.37 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  51.52 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  57.58 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  47.69 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  50.67 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  48.48 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  48 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  48 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  48 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  56.06 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  56.06 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  56.06 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  54.1 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  50.75 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  55 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  39.02 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  52.38 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  48.61 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  52.31 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  49.21 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  40.24 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  50 
 
 		 76 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  50.75 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  55 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  55 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  44 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  49.23 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  49.23 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  47.95 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  50.79 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  48.68 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  39.47 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  43.75 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  47.54 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  49.25 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>