More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0507 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  100 
 
 
77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  61.11 
 
 
74 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  57.33 
 
 
90 aa  91.3  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  56.58 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  57.89 
 
 
76 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  59.21 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  56.58 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  57.33 
 
 
76 aa  84.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  56.58 
 
 
77 aa  84.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  59.42 
 
 
80 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  53.95 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  53.33 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  56.58 
 
 
76 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  55.07 
 
 
77 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  53.95 
 
 
76 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  52 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  57.58 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  53.95 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  53.33 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  51.95 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  52 
 
 
77 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  53.62 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  54.29 
 
 
78 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  53.62 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  52.11 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  52.11 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  53.62 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  52.11 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  50.67 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  51.43 
 
 
78 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  52.05 
 
 
78 aa  76.6  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  50 
 
 
80 aa  77  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  52.11 
 
 
77 aa  76.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  53.33 
 
 
77 aa  77  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  54.41 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  52.17 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  51.43 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  55.07 
 
 
75 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  51.43 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  52.78 
 
 
77 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  55.07 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  55.56 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  52 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  52 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  52 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  51.39 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  52 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  51.95 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  52 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  52.7 
 
 
79 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  52 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  52 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  53.52 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  52.86 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  51.35 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  51.39 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  55.56 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  52 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  52 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  51.35 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  51.39 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  52 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  52.94 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  48 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  50 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  50.67 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  52.94 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  53.42 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  50.67 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  50.67 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  50.67 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  52.94 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  50 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  50.67 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  50.7 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  53.73 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  49.33 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  52.94 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  53.52 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  53.52 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  49.3 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  52.17 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  48 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  48 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  53.52 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  54.17 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  52 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  51.47 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  51.47 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  52 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  50 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  52 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  53.62 
 
 
77 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  51.47 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>