152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04530 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04530  phosphopantetheine-containing protein  100 
 
 
73 aa  140  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.832197  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2777  phosphopantetheine-binding  79.17 
 
 
72 aa  110  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782986  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1990  phosphopantetheine-binding  69.44 
 
 
72 aa  104  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.596379  normal  0.457201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23640  phosphopantetheine-containing protein  69.44 
 
 
72 aa  101  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.309349 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  46.05 
 
 
77 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0345  acyl carrier protein  40 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0352923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  44.44 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  45.21 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0430  acyl carrier protein  38.57 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000189209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  42.67 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  44.44 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  41.89 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  43.06 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  41.33 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  44.74 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  40.54 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  42.03 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  40.28 
 
 
80 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  40.85 
 
 
75 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  40.28 
 
 
80 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2666  acyl carrier protein  37.84 
 
 
78 aa  50.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  41.18 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0822  acyl carrier protein  35.21 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0118181  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  44.74 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  42.25 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  43.42 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  40.28 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  40.28 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  38.89 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  40.79 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  43.06 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  42.11 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  38.67 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  38.67 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  42.65 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  41.43 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  42.03 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  39.44 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  38.03 
 
 
73 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  42.42 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  38.57 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  39.13 
 
 
78 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  39.13 
 
 
78 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  39.13 
 
 
78 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01040  acyl carrier protein  31.51 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.218894 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  39.44 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  38.89 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1041  acyl carrier protein  45.31 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000252182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  37.68 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  36 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4169  phosphopantetheine-binding  32.89 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  40.85 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  37.68 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  37.68 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  39.44 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0725  acyl carrier protein  46.27 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  37.68 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  37.68 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  40.85 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  40.85 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  40.85 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0772  acyl carrier protein  40 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000409893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  36.11 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0990  acyl carrier protein  37.31 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.567267  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  39.71 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  37.14 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  39.71 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  39.71 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  38.03 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  33.78 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  37.5 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  33.33 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  33.33 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  36.99 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  36.99 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  41.18 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>