More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0990 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0990  acyl carrier protein  100 
 
 
82 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.567267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1592  Acyl carrier protein  51.95 
 
 
83 aa  85.5  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0820426  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0310  Acyl carrier protein  49.35 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.697361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  51.35 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  48 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0345  acyl carrier protein  44.44 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0352923  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  46.25 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  47.3 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  43.75 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  45.95 
 
 
77 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  45.07 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  45.95 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0725  acyl carrier protein  41.03 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  43.59 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  44.3 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  43.24 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  43.59 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  42.31 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  52.11 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  52.11 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  45.33 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  50.7 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3690  phosphopantetheine-binding protein  36 
 
 
87 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  44 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0430  acyl carrier protein  40.85 
 
 
74 aa  57.8  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000189209  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  45.71 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  49.28 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  50 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  38.67 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  45.07 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  43.24 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  45.33 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  35.9 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  38.46 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  47.22 
 
 
77 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  35.9 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  47.22 
 
 
77 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  47.22 
 
 
77 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  45.95 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  47.83 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  43.84 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  43.84 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1849  acyl carrier protein  37.84 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000445968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  41.25 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  37.33 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  45.83 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  39.44 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  48.57 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  46.58 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  40.28 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  37.33 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  46.38 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  40 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0822  acyl carrier protein  40.58 
 
 
73 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  44.44 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  46.48 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  41.43 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  37.66 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1088  acyl carrier protein  37.97 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  36 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  37.5 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  47.83 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  46.38 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  43.24 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  43.06 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  37.66 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  46.38 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  44.93 
 
 
78 aa  52  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  37.5 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  44 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  46.38 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  38.96 
 
 
82 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  39.73 
 
 
90 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  44.12 
 
 
78 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  41.89 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  38.96 
 
 
82 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  41.1 
 
 
79 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  42.31 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  41.67 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  44.29 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  43.06 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23640  phosphopantetheine-containing protein  44.78 
 
 
72 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.309349 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  36.84 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  43.94 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  34.62 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>