More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2519 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  100 
 
 
79 aa  154  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  89.74 
 
 
78 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  75.95 
 
 
79 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  77.22 
 
 
78 aa  120  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  77.22 
 
 
78 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  77.22 
 
 
78 aa  120  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  74.36 
 
 
78 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  74.36 
 
 
78 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  81.33 
 
 
77 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  81.33 
 
 
77 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  81.33 
 
 
77 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  83.56 
 
 
77 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  76.62 
 
 
77 aa  116  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  75.64 
 
 
78 aa  115  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  77.22 
 
 
78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  75.32 
 
 
77 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  80.82 
 
 
78 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  80.82 
 
 
78 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  80.82 
 
 
78 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  80.82 
 
 
78 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  77.33 
 
 
77 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  76.71 
 
 
79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  79.45 
 
 
78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  79.45 
 
 
78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  70.89 
 
 
79 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  76.71 
 
 
79 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  76.71 
 
 
79 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  76.71 
 
 
79 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  76.71 
 
 
79 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  76.71 
 
 
79 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  69.62 
 
 
106 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  76.71 
 
 
79 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  76.71 
 
 
79 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  78.08 
 
 
78 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  71.79 
 
 
78 aa  110  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  76.71 
 
 
78 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  70.51 
 
 
78 aa  107  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  73.97 
 
 
77 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  69.23 
 
 
78 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  67.11 
 
 
79 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  63.29 
 
 
79 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  65.79 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  63.64 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  61.64 
 
 
80 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  65.75 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  65.75 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  65.33 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  59.74 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  61.64 
 
 
78 aa  93.6  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  63.64 
 
 
83 aa  93.6  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  59.49 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  64.79 
 
 
75 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  64.94 
 
 
77 aa  93.2  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  64.94 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  69.44 
 
 
78 aa  93.6  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  59.49 
 
 
84 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  57.69 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  60.76 
 
 
79 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  64.47 
 
 
79 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  65.75 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  65.75 
 
 
80 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  64.47 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  64.47 
 
 
79 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  63.51 
 
 
79 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  64.86 
 
 
80 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  65.75 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  65.75 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  63.01 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  62.34 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  62.16 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  63.64 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  62.16 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  64.38 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  62.67 
 
 
79 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  62.16 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  64.38 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  63.01 
 
 
79 aa  90.5  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  58.67 
 
 
78 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  64.38 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  90.5  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  63.51 
 
 
77 aa  90.5  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  61.64 
 
 
77 aa  90.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  59.49 
 
 
84 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  60.81 
 
 
77 aa  90.1  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  60.81 
 
 
77 aa  90.1  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  61.64 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  63.01 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  64.38 
 
 
79 aa  90.1  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  61.04 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  59.46 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  63.01 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  63.01 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  62.16 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  60.27 
 
 
82 aa  88.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  60.81 
 
 
78 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>