More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1088 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1088  acyl carrier protein  100 
 
 		 80 aa  155  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  48.15 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  50 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  50.72 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  51.43 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  50.7 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  50.7 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  50.7 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  51.39 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  50 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  50.72 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  50.72 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  53.12 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  48 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  49.25 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  45 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  50.7 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  53.12 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  40 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  51.56 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  47.95 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  53.03 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  43.04 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  50 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  46.27 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  47.83 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  43.84 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  44 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  48.48 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  51.56 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0433  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.145071  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  45.59 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  45.57 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  49.21 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  48.53 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  51.56 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>