86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0487 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0487  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
88 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2518  phosphopantetheine-binding  33.77 
 
 
83 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0397  phosphopantetheine-binding  32.91 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  31.17 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2375  hypothetical protein  42.22 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  33.75 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  33.33 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  30.26 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3788  acyl carrier protein  31.33 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155338  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0048  acyl carrier protein  33.73 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.858481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  38.24 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_003296  RS02218  acyl-carrier-protein  32.31 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1515  phosphopantetheine-binding  34.67 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  35.29 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  35.29 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  35.29 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  29.87 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  35.29 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  35.29 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  35.29 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  35.71 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  32 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31440  acyl carrier protein  28.57 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.820176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  32.88 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  31.75 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  52.27 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  36.76 
 
 
79 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  29.87 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  33.33 
 
 
78 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0385  acyl carrier protein  35 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.061786  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  29.87 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  35.29 
 
 
79 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  35.71 
 
 
78 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  38.03 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1041  acyl carrier protein  33.33 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000252182  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  35.48 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  31.43 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0725  acyl carrier protein  28.05 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  30.67 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  29.87 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1090  hypothetical protein  28.95 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  30.14 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  29.87 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  31.94 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  27.5 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  29.87 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  31.94 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  27.27 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  27.5 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  31.94 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  30 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  30.38 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0219  Acyl carrier protein  38.6 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  33.33 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  32.86 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  33.82 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  29.17 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3396  hypothetical protein  30 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225214  hitchhiker  0.000000113097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  29.17 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  29.87 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0881  acyl carrier protein  38.6 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.215999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  33.82 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  29.87 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  29.17 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  29.17 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  28.57 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1193  acyl carrier protein  25 
 
 
86 aa  40  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>