More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02218 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02218  acyl-carrier-protein  100 
 
 		 87 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  40.79 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  40.79 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  40.51 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  38.55 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  40.79 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  40.48 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  35.37 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  38.75 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  38.75 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  40.28 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1849  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000445968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  34.57 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  39.47 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  44 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  38.96 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0458  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.89611  normal  0.887307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26769  predicted protein  43.66 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.973037  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  41.89 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  40 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  41.33 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  39.47 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  39.47 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 79 aa  57  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  34.25 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  41.79 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0522  acyl carrier protein  40.51 
 
 		 78 aa  57  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000162549  hitchhiker  0.00260243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>