28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2375 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2375  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  160  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  35.62 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0487  phosphopantetheine-binding  42.22 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3419  acyl carrier protein  34.62 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2518  phosphopantetheine-binding  38.6 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40310  putative acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0674269  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  30.49 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  40 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  35.29 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  34.25 
 
 
79 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  32.43 
 
 
79 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  27.27 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  32.1 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0658  phosphopantetheine-binding  31.17 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00184393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  32.43 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  32.1 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  32.1 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  32.1 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  36.76 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  34.18 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  36.76 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  31.17 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  35.59 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  32.93 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  29.87 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  30.86 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  29.87 
 
 
79 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>