More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40310 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_40310  putative acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0674269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3419  acyl carrier protein  93.67 
 
 		 79 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  65.28 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  65.28 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  65.28 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  63.89 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  63.89 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  61.11 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  60.27 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  61.64 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  61.11 
 
 		 79 aa  86.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  57.53 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 77 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  55.22 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  56 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  51.32 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  51.28 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  51.32 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  51.28 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  51.32 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  49.35 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  52 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  52 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  49.35 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  53.52 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  50.63 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  50.65 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  46.75 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  46.75 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  48.68 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>