More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4192 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  85.9 
 
 		 78 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  84.62 
 
 		 78 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  82.05 
 
 		 78 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  87.84 
 
 		 78 aa  131  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  83.33 
 
 		 78 aa  130  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  83.12 
 
 		 79 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  84 
 
 		 77 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  73.68 
 
 		 82 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  71.05 
 
 		 78 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  71.05 
 
 		 78 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  69.33 
 
 		 78 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 79 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 79 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 77 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  65.33 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  65.33 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 77 aa  99.4  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 78 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 78 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 78 aa  96.7  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 77 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 78 aa  94.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 79 aa  93.6  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 76 aa  93.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>