More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0908 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 
88 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  46.84 
 
 
83 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  46.84 
 
 
83 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  44.3 
 
 
81 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  44.16 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  41.77 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  52.05 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  41.77 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  44.3 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  44.3 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  43.04 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  42.5 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  42.11 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  41.1 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  38.75 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  36.71 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  39.13 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  36.84 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  40.58 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  39.76 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  35.44 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  37.18 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  39.24 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  41.27 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  39.47 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  39.47 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  39.47 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  36.84 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  39.47 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  37.97 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  32.14 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  35 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  36.71 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  34.62 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  36 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  35.9 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  38.16 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  37.18 
 
 
80 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  35.44 
 
 
79 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  37.97 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  35.9 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  35.9 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  35.9 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  34.94 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  36.84 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  36.84 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  42.19 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  35.9 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2663  putative acyl carrier protein  54.39 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  40.62 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  40.98 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  36.84 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  35.06 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  35.53 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  35.62 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  32 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  35.53 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  34.88 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  42.37 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  32.89 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  36.84 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  38.33 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  35.44 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  38.33 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  38.33 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  33.72 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  35.53 
 
 
82 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  35.21 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  43.86 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  34.67 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  36.67 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  35.14 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  39.47 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  33.8 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  35.14 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  40.85 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  35.53 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  34.21 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  34.21 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  34.21 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  30 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  34.72 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  34.72 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  35.06 
 
 
84 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  33.75 
 
 
80 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  36.84 
 
 
78 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  34.72 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  38.33 
 
 
92 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  38.98 
 
 
105 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  34.21 
 
 
80 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  31.58 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  34.21 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  36.11 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9709  predicted protein  33.33 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14468  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  36.23 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  34.25 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>