69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5094 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  100 
 
 		 86 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  95.24 
 
 		 84 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  83.13 
 
 		 84 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  53.01 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  56.1 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 82 aa  90.5  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 82 aa  90.1  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  50 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  56.25 
 
 		 80 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  55 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  55 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  55 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  55 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  51.22 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  53.75 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  49.35 
 
 		 81 aa  86.7  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  53.75 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  53.75 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  53.75 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  51.25 
 
 		 82 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  53.66 
 
 		 82 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  51.85 
 
 		 82 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  55.26 
 
 		 82 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  55 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  55 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  51.85 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  48.1 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  51.85 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  46.91 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  45 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  48.75 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  47.44 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  49.38 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  34.25 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  43.86 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  32.91 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  31.65 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  37.31 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  36.99 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1088  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3263  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0779  phosphopantetheine-binding protein  28.57 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  34.67 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  30.38 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  34.25 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0990  acyl carrier protein  31.25 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.567267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  36 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 81 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1865  phosphopantetheine-binding  36.25 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 81 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  34.94 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  30.86 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  30.38 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>