71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0112 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  64.94 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  53.09 
 
 		 86 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  51.81 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  53.33 
 
 		 82 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  50 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  51.28 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  50.63 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  48.05 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  50 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  48 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  48 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  44.16 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  43.75 
 
 		 82 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  52.24 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  43.59 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  41.46 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  41.46 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  43.59 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  44.26 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  37.18 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  37.18 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  43.06 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  42.86 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  35.06 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  34.94 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  34.18 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  36.07 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  35.38 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  35.38 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  32.1 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  29.73 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  30.26 
 
 		 80 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4159  phosphopantetheine-binding protein  30.99 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840095  normal  0.670614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2744  acyl carrier protein  31.4 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0330555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  43.9 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  28.05 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0482  phosphopantetheine-binding protein  30.95 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  28.17 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 79 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>