106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0482 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0482  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 
90 aa  178  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03737  acyl carrier protein  70.11 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2070  acyl carrier protein  65.17 
 
 
89 aa  120  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1993  acyl carrier protein  65.12 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.275282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1316  acyl carrier protein  62.79 
 
 
101 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0612276  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2669  acyl carrier protein  60.92 
 
 
103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0914  acyl carrier protein  59.04 
 
 
121 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4171  acyl carrier protein  59.76 
 
 
94 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2811  acyl carrier protein  56.1 
 
 
94 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2678  acyl carrier protein  56.1 
 
 
94 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0063  acyl carrier protein  58.33 
 
 
94 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6089  acyl carrier protein  54.88 
 
 
87 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2749  acyl carrier protein, putative  52.38 
 
 
87 aa  96.7  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3923  acyl carrier protein, putative  54.22 
 
 
85 aa  96.7  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2145  acyl carrier protein  53.66 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2759  acyl carrier protein  53.66 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1379  acyl carrier protein  54.12 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.1236  hitchhiker  0.00487653 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2103  putative acyl carrier protein  53.01 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3980  acyl carrier protein  50.59 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0940  acyl carrier protein  47.19 
 
 
88 aa  90.1  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.923703  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0797  acyl carrier protein, putative  47.19 
 
 
88 aa  90.1  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4378  acyl carrier protein  50.6 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00196249  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0434  acyl carrier protein  45.35 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3295  acyl carrier protein  52.94 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.771015  normal  0.397589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2744  acyl carrier protein  53.66 
 
 
89 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0330555  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004064  acyl carrier protein  50.6 
 
 
86 aa  87.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3934  acyl carrier protein  46.91 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3888  acyl carrier protein, putative  49.4 
 
 
84 aa  86.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.626609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0890  putative acyl carrier protein  45.98 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.496205  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0310  acyl carrier protein  48.15 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.274397  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4800  acyl carrier protein  49.4 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0322  acyl carrier protein  48.15 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4596  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5093  acyl carrier protein, putative  48.15 
 
 
86 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2173  acyl carrier protein  49.37 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.894789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3511  acyl carrier protein, putative  46.99 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0728445  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0968  acyl carrier protein  50.63 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000336457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0437  acyl carrier protein, putative  48.15 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0344  acyl carrier protein, putative  47.56 
 
 
84 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125407  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0342  acyl carrier protein, putative  49.38 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0340  acyl carrier protein, putative  49.38 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0347  acyl carrier protein, putative  49.38 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0350  acyl carrier protein, putative  49.38 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4368  acyl carrier protein, putative  47.56 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0350  acyl carrier protein, putative  47.56 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3676  acyl carrier protein, putative  47.56 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101588  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0446  acyl carrier protein, putative  49.38 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1488  acyl carrier protein  53.25 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0325  acyl carrier protein, putative  49.4 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0439  acyl carrier protein, putative  45.12 
 
 
86 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0242  acyl carrier protein  47.44 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0649856  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0111  acyl carrier protein  46.34 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3379  acyl carrier protein, putative  45.12 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3875  acyl carrier protein, putative  41.86 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3612  hypothetical protein  47.44 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2651  acyl-carrier protein  45.78 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0385  acyl carrier protein  42.68 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.061786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0352  hypothetical protein  44.44 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03870  acyl-carrier protein-like protein  43.37 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00794  putative acyl-carrier-protein  39.76 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0744  hypothetical protein  44.58 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1865  phosphopantetheine-binding  46.05 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1089  hypothetical protein  42.17 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  43.04 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1945  putative acyl-carrier-protein  46.84 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2206  phosphopantetheine-binding  44.59 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3886  putative acyl carrier protein  48.19 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0928  putative acyl-carrier protein  39.76 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2116  acyl carrier protein  40.26 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3063  putative acyl-carrier protein  39.76 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0691  putative acyl-carrier protein  38.55 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0678005  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0438  phosphopantetheine-binding protein  37.18 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0477686  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4762  putative acyl-carrier protein  36.14 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227454  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3685  putative acyl-carrier protein  36.14 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2124  acyl-carrier protein  41.03 
 
 
83 aa  67  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6845  acyl-carrier protein  38.27 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4569  hypothetical protein  66.67 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2109  acyl carrier protein  43.21 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0923  acyl-carrier protein-like protein  32.94 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1990  acyl-carrier protein  34.52 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5802  acyl carrier protein  41.67 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.804663  normal  0.487343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0219  phosphopantetheine-binding protein  44.74 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3599  putative acyl-carrier-protein  32.18 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.681248  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4074  putative acyl-carrier-protein  32.18 
 
 
101 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0665  acyl carrier protein AcpC  45.61 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  42.62 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  39.34 
 
 
76 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  34.12 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29810  acyl carrier protein  35.14 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  40.98 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  34.12 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2525  hypothetical protein  44 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2373  acyl carrier protein  38.98 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0279072  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  39.39 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  36.71 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  35.8 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  29.27 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  34.94 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  30.12 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3788  acyl carrier protein  32.18 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>