58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2525 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2525  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  43.24 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4378  acyl carrier protein  41.46 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00196249  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3923  acyl carrier protein, putative  45.45 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  34.62 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3685  putative acyl-carrier protein  38.46 
 
 		 85 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0691  putative acyl-carrier protein  37.18 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0678005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4762  putative acyl-carrier protein  38.46 
 
 		 85 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0928  putative acyl-carrier protein  36.59 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3379  acyl carrier protein, putative  39.51 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0890  putative acyl carrier protein  38.96 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.496205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4800  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3612  hypothetical protein  36.99 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2749  acyl carrier protein, putative  37.5 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1945  putative acyl-carrier-protein  40.26 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3063  putative acyl-carrier protein  35.9 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00794  putative acyl-carrier-protein  38.46 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0923  acyl-carrier protein-like protein  33.75 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0340  acyl carrier protein, putative  42.31 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0347  acyl carrier protein, putative  42.31 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0219  phosphopantetheine-binding protein  43.94 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0350  acyl carrier protein, putative  42.31 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0342  acyl carrier protein, putative  42.31 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0968  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000336457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5093  acyl carrier protein, putative  32.91 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0437  acyl carrier protein, putative  32.91 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0482  phosphopantetheine-binding protein  44 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03737  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0385  acyl carrier protein  40 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.061786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2651  acyl-carrier protein  35 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0446  acyl carrier protein, putative  41.03 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0439  acyl carrier protein, putative  34.62 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0325  acyl carrier protein, putative  41.03 
 
 		 84 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1316  acyl carrier protein  37.84 
 
 		 101 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0612276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0344  acyl carrier protein, putative  37.97 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3511  acyl carrier protein, putative  37.04 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0728445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0352  hypothetical protein  36.71 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3676  acyl carrier protein, putative  37.97 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0350  acyl carrier protein, putative  37.97 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  31.08 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3888  acyl carrier protein, putative  37.66 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.626609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1865  phosphopantetheine-binding  39.19 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 77 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4368  acyl carrier protein, putative  38.75 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2173  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.894789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4171  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0242  acyl carrier protein  32 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0649856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0797  acyl carrier protein, putative  38.33 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0940  acyl carrier protein  38.33 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.923703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  32.39 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3886  putative acyl carrier protein  38.96 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2070  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 89 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 110 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>