172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0219 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0219  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 
95 aa  185  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29810  acyl carrier protein  53.76 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0665  acyl carrier protein AcpC  49.45 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004064  acyl carrier protein  43.37 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0439  acyl carrier protein, putative  49.15 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0350  acyl carrier protein, putative  43.9 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3676  acyl carrier protein, putative  43.9 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101588  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3384  phosphopantetheine-binding  37.18 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0385  acyl carrier protein  45 
 
 
87 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.061786  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5093  acyl carrier protein, putative  42.31 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1865  phosphopantetheine-binding  39.51 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0344  acyl carrier protein, putative  43.9 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125407  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2173  acyl carrier protein  35.37 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.894789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0242  acyl carrier protein  40 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0649856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0437  acyl carrier protein, putative  42.31 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0482  phosphopantetheine-binding protein  44.74 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3379  acyl carrier protein, putative  46.05 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5802  acyl carrier protein  40.74 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.804663  normal  0.487343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4368  acyl carrier protein, putative  43.9 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0350  acyl carrier protein, putative  43.9 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0342  acyl carrier protein, putative  43.9 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0340  acyl carrier protein, putative  43.9 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0968  acyl carrier protein  36.59 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000336457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0347  acyl carrier protein, putative  43.9 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2744  acyl carrier protein  39.51 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0330555  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1286  putative acyl-carrier protein  41.89 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.121745 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0063  acyl carrier protein  39.74 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0446  acyl carrier protein, putative  43.9 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03737  acyl carrier protein  40.91 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  38.75 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2651  acyl-carrier protein  44.16 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4596  hypothetical protein  44 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4800  acyl carrier protein  38.27 
 
 
85 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0890  putative acyl carrier protein  37.97 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.496205  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3888  acyl carrier protein, putative  43.42 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.626609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2103  putative acyl carrier protein  39.02 
 
 
85 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2373  acyl carrier protein  37.66 
 
 
89 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0279072  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0352  hypothetical protein  44.3 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3511  acyl carrier protein, putative  43.42 
 
 
84 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0728445  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3612  hypothetical protein  48.33 
 
 
85 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4171  acyl carrier protein  37.18 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1488  acyl carrier protein  48.21 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  32.89 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2749  acyl carrier protein, putative  45.31 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6845  acyl-carrier protein  36.14 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0325  acyl carrier protein, putative  41.77 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2206  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0923  acyl-carrier protein-like protein  39.51 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00794  putative acyl-carrier-protein  41.43 
 
 
85 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0928  putative acyl-carrier protein  42.25 
 
 
99 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2070  acyl carrier protein  39.47 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1379  acyl carrier protein  34.67 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.1236  hitchhiker  0.00487653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1316  acyl carrier protein  37.68 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0612276  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2116  acyl carrier protein  34.18 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0744  hypothetical protein  36.71 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  34.57 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  32.43 
 
 
82 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  32.43 
 
 
82 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1993  acyl carrier protein  39.47 
 
 
87 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.275282  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0691  putative acyl-carrier protein  42.25 
 
 
99 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0678005  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  36.11 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3685  putative acyl-carrier protein  40 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  34.72 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4762  putative acyl-carrier protein  40 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227454  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  34.25 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3923  acyl carrier protein, putative  41.54 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  37.14 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0914  acyl carrier protein  38.67 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  33.75 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3063  putative acyl-carrier protein  41.43 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  37.14 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  36.11 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  32.5 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  32.43 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3875  acyl carrier protein, putative  37.33 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6525  hypothetical protein  43.55 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519859  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  32 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2525  hypothetical protein  43.94 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  29.87 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  31.94 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  34.67 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3886  putative acyl carrier protein  35.8 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  32.43 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  36.11 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3980  acyl carrier protein  38.46 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  34.72 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  34.72 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2669  acyl carrier protein  36.23 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  34.72 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  34.72 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  33.33 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  33.33 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>