34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3384 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3384  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2373  acyl carrier protein  60 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0279072  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3978  acyl carrier protein  60.49 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2109  acyl carrier protein  39.33 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0219  phosphopantetheine-binding protein  37.18 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5802  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.804663  normal  0.487343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0242  acyl carrier protein  35.8 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0649856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1865  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0439  acyl carrier protein, putative  36.11 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2651  acyl-carrier protein  40.54 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0437  acyl carrier protein, putative  40.28 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5093  acyl carrier protein, putative  38.89 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2124  acyl-carrier protein  34.67 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2206  phosphopantetheine-binding  33.72 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0744  hypothetical protein  32.05 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2749  acyl carrier protein, putative  35.44 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3875  acyl carrier protein, putative  38.75 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6845  acyl-carrier protein  31.65 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0923  acyl-carrier protein-like protein  35.38 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  30.95 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0665  acyl carrier protein AcpC  32.53 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0438  phosphopantetheine-binding protein  34.67 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0477686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4171  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0063  acyl carrier protein  27.5 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0385  acyl carrier protein  28.24 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.061786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29810  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2744  acyl carrier protein  29.58 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0330555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03737  acyl carrier protein  33.75 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1993  acyl carrier protein  32.93 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.275282  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2070  acyl carrier protein  32.93 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0968  acyl carrier protein  31.4 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000336457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3923  acyl carrier protein, putative  34.25 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2103  putative acyl carrier protein  31.17 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  39.34 
 
 		 83 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>