104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29810  acyl carrier protein  100 
 
 		 106 aa  215  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0219  phosphopantetheine-binding protein  53.76 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0665  acyl carrier protein AcpC  48.81 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2116  acyl carrier protein  43.59 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0242  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0649856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2651  acyl-carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1865  phosphopantetheine-binding  40.28 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2173  acyl carrier protein  38.75 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.894789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2206  phosphopantetheine-binding  42.47 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  40.26 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1089  hypothetical protein  37.97 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0923  acyl-carrier protein-like protein  40.48 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3612  hypothetical protein  41.25 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2744  acyl carrier protein  30.95 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0330555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0385  acyl carrier protein  48.21 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.061786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0744  hypothetical protein  39.73 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0063  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0439  acyl carrier protein, putative  43.42 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4368  acyl carrier protein, putative  41.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3980  acyl carrier protein  30.49 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0350  acyl carrier protein, putative  41.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3676  acyl carrier protein, putative  41.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0342  acyl carrier protein, putative  41.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0446  acyl carrier protein, putative  41.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0340  acyl carrier protein, putative  41.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0347  acyl carrier protein, putative  41.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4800  acyl carrier protein  41.89 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0350  acyl carrier protein, putative  41.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004064  acyl carrier protein  39.24 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0344  acyl carrier protein, putative  41.25 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0968  acyl carrier protein  36.14 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000336457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0890  putative acyl carrier protein  41.46 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.496205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2124  acyl-carrier protein  39.19 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4171  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0352  hypothetical protein  44 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1488  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5093  acyl carrier protein, putative  43.04 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4378  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00196249  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0437  acyl carrier protein, putative  43.04 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3379  acyl carrier protein, putative  43.24 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5802  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.804663  normal  0.487343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3923  acyl carrier protein, putative  44.3 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1286  putative acyl-carrier protein  34.57 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0914  acyl carrier protein  28.77 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2373  acyl carrier protein  37.84 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0279072  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03870  acyl-carrier protein-like protein  36.25 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1316  acyl carrier protein  33.72 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0612276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3511  acyl carrier protein, putative  41.33 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0728445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0940  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.923703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0797  acyl carrier protein, putative  31.51 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1379  acyl carrier protein  28.77 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.1236  hitchhiker  0.00487653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4596  hypothetical protein  41.33 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2103  putative acyl carrier protein  38.67 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2669  acyl carrier protein  36.23 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0482  phosphopantetheine-binding protein  35.37 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6525  hypothetical protein  34.21 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4135  phosphopantetheine-binding protein  39.44 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3934  acyl carrier protein  32 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0325  acyl carrier protein, putative  40 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6845  acyl-carrier protein  36.71 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0438  phosphopantetheine-binding protein  37.84 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0477686  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2749  acyl carrier protein, putative  40.54 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0310  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.274397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0322  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2109  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0434  acyl carrier protein  28.38 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3295  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.771015  normal  0.397589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2145  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0111  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2759  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3875  acyl carrier protein, putative  39.19 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6089  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03737  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3888  acyl carrier protein, putative  37.66 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.626609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2811  acyl carrier protein  30.23 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  28.24 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2070  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2678  acyl carrier protein  30.23 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3384  phosphopantetheine-binding  34.67 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3886  putative acyl carrier protein  38.16 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  36.99 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1756  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0431  putative acyl carrier protein  32.89 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  32.91 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  29.27 
 
 		 81 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  29.27 
 
 		 81 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0140  hypothetical protein  28.57 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1990  acyl-carrier protein  38.36 
 
 		 86 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4569  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1193  acyl carrier protein  28.4 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00794  putative acyl-carrier-protein  36.84 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3978  acyl carrier protein  36.25 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  26.74 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1993  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.275282  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>