87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0434 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0434  acyl carrier protein  100 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0322  acyl carrier protein  83.72 
 
 		 86 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0310  acyl carrier protein  83.72 
 
 		 86 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.274397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2759  acyl carrier protein  79.78 
 
 		 94 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2145  acyl carrier protein  79.78 
 
 		 94 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6089  acyl carrier protein  81.4 
 
 		 87 aa  147  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2811  acyl carrier protein  78.65 
 
 		 94 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2678  acyl carrier protein  78.65 
 
 		 94 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3934  acyl carrier protein  73.86 
 
 		 110 aa  137  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2744  acyl carrier protein  55.42 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0330555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0914  acyl carrier protein  59.04 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03737  acyl carrier protein  47.19 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1993  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 87 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.275282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2669  acyl carrier protein  46.79 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2070  acyl carrier protein  47.31 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1379  acyl carrier protein  53.06 
 
 		 98 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.1236  hitchhiker  0.00487653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0063  acyl carrier protein  54.12 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3980  acyl carrier protein  54.22 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1316  acyl carrier protein  54.22 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0612276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0482  phosphopantetheine-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4171  acyl carrier protein  51.16 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3295  acyl carrier protein  50 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.771015  normal  0.397589 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4378  acyl carrier protein  45.24 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00196249  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2103  putative acyl carrier protein  42.86 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302874  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1089  hypothetical protein  41.86 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03870  acyl-carrier protein-like protein  40.7 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0439  acyl carrier protein, putative  40.48 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3923  acyl carrier protein, putative  41.67 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2173  acyl carrier protein  44.05 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.894789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0968  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000336457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0437  acyl carrier protein, putative  39.29 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5093  acyl carrier protein, putative  39.29 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004064  acyl carrier protein  34.94 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0744  hypothetical protein  43.68 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2749  acyl carrier protein, putative  40.96 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0344  acyl carrier protein, putative  36.59 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0890  putative acyl carrier protein  38.37 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.496205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4800  acyl carrier protein  39.29 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0350  acyl carrier protein, putative  38.1 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0347  acyl carrier protein, putative  38.1 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0340  acyl carrier protein, putative  38.1 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0342  acyl carrier protein, putative  38.1 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0350  acyl carrier protein, putative  36.59 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3676  acyl carrier protein, putative  36.59 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0446  acyl carrier protein, putative  37.04 
 
 		 84 aa  67  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272057  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0797  acyl carrier protein, putative  40 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3511  acyl carrier protein, putative  34.15 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0728445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2116  acyl carrier protein  39.76 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0940  acyl carrier protein  40 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.923703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4368  acyl carrier protein, putative  35.8 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0111  acyl carrier protein  40.24 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0385  acyl carrier protein  37.35 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.061786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2651  acyl-carrier protein  36.59 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1488  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4596  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0325  acyl carrier protein, putative  32.93 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3888  acyl carrier protein, putative  31.71 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.626609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3379  acyl carrier protein, putative  32.1 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0352  hypothetical protein  34.12 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1865  phosphopantetheine-binding  37.65 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3875  acyl carrier protein, putative  36.9 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0438  phosphopantetheine-binding protein  34.62 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0477686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0928  putative acyl-carrier protein  34.12 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3612  hypothetical protein  34.62 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3063  putative acyl-carrier protein  34.12 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0691  putative acyl-carrier protein  34.12 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0678005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0923  acyl-carrier protein-like protein  32.14 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0242  acyl carrier protein  34.57 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0649856  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4762  putative acyl-carrier protein  32.94 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3685  putative acyl-carrier protein  32.94 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3886  putative acyl carrier protein  38.1 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_003296  RS00794  putative acyl-carrier-protein  32.94 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2124  acyl-carrier protein  38.46 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1945  putative acyl-carrier-protein  38.82 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6845  acyl-carrier protein  32.14 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  32.56 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4569  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2206  phosphopantetheine-binding  32.5 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1990  acyl-carrier protein  34.88 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3599  putative acyl-carrier-protein  29.41 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.681248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4074  putative acyl-carrier-protein  29.41 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5802  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.804663  normal  0.487343 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0665  acyl carrier protein AcpC  35.06 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29810  acyl carrier protein  28.38 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2109  acyl carrier protein  29.76 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0779  phosphopantetheine-binding protein  30.86 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1286  putative acyl-carrier protein  30.14 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>