32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3647 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  216  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  69.9 
 
 
107 aa  145  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  46.99 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4495  hypothetical protein  49.35 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  49.33 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1084  hypothetical protein  41.18 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.482733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  42.35 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  40.26 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2790  hypothetical protein  35.44 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  42.47 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  42.47 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  32.53 
 
 
84 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  33.75 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  33.75 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  32.53 
 
 
84 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  37.35 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  32.5 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4316  hypothetical protein  32.53 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0266  hypothetical protein  32 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  36.14 
 
 
85 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  35.53 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2354  hypothetical protein  42.11 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0133  hypothetical protein  30.59 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29810  acyl carrier protein  34.52 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  33.75 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  34.55 
 
 
76 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  38.18 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0698  hypothetical protein  40.43 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  34.62 
 
 
79 aa  40  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>