26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0732 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  95.51 
 
 
89 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  39.47 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  34.62 
 
 
85 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  34.62 
 
 
85 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  34.29 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0987  hypothetical protein  31.43 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  35.59 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3186  hypothetical protein  33.75 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  25.68 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  42.31 
 
 
84 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  35.38 
 
 
87 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  38.18 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  29.55 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  33.87 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  33.85 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  32.76 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  36.92 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  36.36 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3280  hypothetical protein  42.31 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  30.77 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2021  hypothetical protein  35.09 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  29.31 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2184  hypothetical protein  34.55 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  36.51 
 
 
83 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  31.34 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>