29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2955 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  97.7 
 
 
87 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  70.24 
 
 
84 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2790  hypothetical protein  69.62 
 
 
84 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  63.1 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  41.25 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1084  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.482733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  46.25 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  42.31 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  42.31 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  46.58 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  43.84 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4495  hypothetical protein  46.58 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  42.47 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  46 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  46 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  36.92 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  35.38 
 
 
89 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  33.77 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1865  phosphopantetheine-binding  39.68 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4316  hypothetical protein  27.78 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0266  hypothetical protein  28.99 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2938  phosphopantetheine-binding  37.66 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.964017  normal  0.466859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  27.85 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2651  acyl-carrier protein  28.05 
 
 
83 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1291  hypothetical protein  38 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  35.53 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0928  phosphopantetheine-binding  29.63 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.702434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2184  hypothetical protein  38.78 
 
 
78 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>