27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0719 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  95.51 
 
 		 89 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  35.71 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  28.38 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  35.59 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0987  hypothetical protein  31.43 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  36.92 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3186  hypothetical protein  33.75 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  42.31 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  36.92 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  29.55 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  38.46 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2184  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  32.76 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  32.26 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3280  hypothetical protein  40.74 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  30.77 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  29.31 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  36.51 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  32.76 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2354  hypothetical protein  36.62 
 
 		 85 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>