30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3412 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  167  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  49.15 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0987  hypothetical protein  45 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  35.62 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  44.74 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  42.47 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  47.17 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  30.49 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  32.5 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3280  hypothetical protein  31.17 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  28.38 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  25.68 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3186  hypothetical protein  36 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  33.9 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1924  hypothetical protein  37.04 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1913  hypothetical protein  37.04 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  32.69 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  27.85 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  23.38 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  26.19 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  26.19 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2047  hypothetical protein  22.54 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4316  hypothetical protein  27.63 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1081  phosphopantetheine-binding protein  30.14 
 
 		 81 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0698  hypothetical protein  36.92 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.482733  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1291  hypothetical protein  23.94 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1372  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  29.49 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.896252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  31.25 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>