18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4316 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4316  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  40.74 
 
 
83 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  38.67 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  32.53 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  28.75 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  28.95 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1084  hypothetical protein  28.95 
 
 
100 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.482733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  27.5 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  30.77 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  27.85 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  27.5 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  26.67 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2790  hypothetical protein  26.32 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  27.78 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  30 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  25.97 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  27.63 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0385  acyl carrier protein  35.44 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.061786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>