31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0491 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  215  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  69.9 
 
 
107 aa  145  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  46.91 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1084  hypothetical protein  47.56 
 
 
100 aa  84  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.482733  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  47.56 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  51.28 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4495  hypothetical protein  42.68 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2790  hypothetical protein  37.8 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  43.84 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  35.06 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  36.36 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  43.84 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  41.77 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  32.93 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  32.93 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  30.49 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0266  hypothetical protein  35.9 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  38.16 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2354  hypothetical protein  37.93 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4316  hypothetical protein  30.77 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  41.82 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  38.18 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29810  acyl carrier protein  36.36 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  36.36 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  37.5 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2021  hypothetical protein  36 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1291  hypothetical protein  38.89 
 
 
78 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17180  hypothetical protein  32.2 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>