19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7012 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  167  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  60.26 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  58.67 
 
 
85 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0987  hypothetical protein  49.33 
 
 
79 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  55.07 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  42.47 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  44.26 
 
 
76 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3280  hypothetical protein  41.67 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3186  hypothetical protein  40.58 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  29.31 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  29.31 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  35.19 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  35.19 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  35.19 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1924  hypothetical protein  28.38 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  35.19 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  38.18 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  35.19 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1913  hypothetical protein  28.38 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>