41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3637 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  100 
 
 		 83 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  100 
 
 		 83 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  95.18 
 
 		 103 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  95.18 
 
 		 103 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  95.18 
 
 		 103 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  93.98 
 
 		 83 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4391  acyl carrier protein  84.34 
 
 		 83 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  75.9 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  75.9 
 
 		 83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  75.9 
 
 		 83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  75.9 
 
 		 83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  75.9 
 
 		 83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  75.9 
 
 		 83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  75.9 
 
 		 83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  73.49 
 
 		 83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  50.6 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  50.6 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  49.4 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5360  acyl carrier protein  49.4 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2037  acyl carrier protein  49.4 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  45.78 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  44.58 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1477  acyl carrier protein  43.37 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  49.32 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  38.75 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  58 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  40.26 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3404  hypothetical protein  47.83 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04727  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  34.33 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4417  hypothetical protein  38.98 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5059  hypothetical protein  39.62 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4598  hypothetical protein  39.62 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180568  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3256  phosphopantetheine-binding  38.16 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  39.53 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0242  acyl carrier protein  41.86 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0649856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2206  phosphopantetheine-binding  41.86 
 
 		 85 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  41.18 
 
 		 85 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0682  phosphopantetheine-binding  31.51 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  35.19 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>