53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3303 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  96.39 
 
 
83 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  95.18 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  95.18 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4391  acyl carrier protein  86.75 
 
 
83 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  77.11 
 
 
83 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  77.11 
 
 
83 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  75.29 
 
 
114 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  77.11 
 
 
83 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  77.11 
 
 
83 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  77.11 
 
 
83 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  77.11 
 
 
83 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  74.7 
 
 
83 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  49.4 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  49.4 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  49.4 
 
 
83 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5360  acyl carrier protein  48.19 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2037  acyl carrier protein  48.19 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  49.28 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1477  acyl carrier protein  44.3 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  43.04 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  50.72 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  37.04 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  42.67 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  38.96 
 
 
78 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  40.28 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3404  hypothetical protein  47.83 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04727  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4417  hypothetical protein  36.92 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  39.53 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4598  hypothetical protein  39.62 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180568  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5059  hypothetical protein  39.62 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2206  phosphopantetheine-binding  41.86 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3256  phosphopantetheine-binding  42.11 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0242  acyl carrier protein  41.86 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0649856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  33.33 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  41.18 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  35.19 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0682  phosphopantetheine-binding  38 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1913  hypothetical protein  32.47 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1924  hypothetical protein  32.47 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01924  hypothetical protein  35.82 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150472 
 
 
-
 
NC_002978  WD1193  acyl carrier protein  33.33 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  34.69 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  30.67 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05704  acyl carrier protein, putative (JCVI)  35.59 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.922382  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  39.62 
 
 
78 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  38.89 
 
 
78 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  39.62 
 
 
78 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  39.62 
 
 
78 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  38.89 
 
 
78 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>