33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1076 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  100 
 
 
82 aa  164  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  52.7 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  50.67 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1477  acyl carrier protein  45.33 
 
 
83 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  48.44 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  44.44 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  48.44 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  42.11 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  41.67 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  41.33 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  37.97 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5360  acyl carrier protein  41.67 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4391  acyl carrier protein  43.06 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2037  acyl carrier protein  36 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  36.11 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  36.11 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  36.11 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  36.11 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  40.28 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  40.28 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  39.19 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  40.28 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  39.19 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  36.11 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  36.11 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  36.11 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  36.11 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  38.89 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2687  phosphopantetheine-binding  36.71 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161716  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  35.62 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0682  phosphopantetheine-binding  37.33 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  34.62 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2776  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0180647  decreased coverage  0.000606651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>