40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1719 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  100 
 
 
83 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  95.18 
 
 
83 aa  151  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5360  acyl carrier protein  69.88 
 
 
83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  66.27 
 
 
83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  59.04 
 
 
83 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  57.83 
 
 
83 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  57.83 
 
 
83 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  56.63 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  56.63 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  56.63 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  56.63 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  57.83 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2037  acyl carrier protein  56.63 
 
 
86 aa  93.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  51.81 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  49.4 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  49.4 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  49.4 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  49.4 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  49.4 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4391  acyl carrier protein  48.19 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1477  acyl carrier protein  45.78 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  49.33 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  44.58 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  43.37 
 
 
83 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  44.58 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  45.45 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  44.44 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  43.59 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  41.54 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0250  D-alanyl carrier protein  37.04 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.22726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0439  acyl carrier protein, putative  41.79 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4598  hypothetical protein  45.76 
 
 
89 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180568  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0682  phosphopantetheine-binding  32.76 
 
 
80 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0923  acyl-carrier protein-like protein  35.48 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5059  hypothetical protein  45.76 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  42.31 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1788  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  39.29 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2651  acyl-carrier protein  35.48 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  68 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  40.38 
 
 
79 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>